Posição do mouse via python, no Ubuntu

Utilizei a biblioteca Xlib para pegar as coordenadas x e y do mouse:

from Xlib import X, display
import time

d = display.Display().screen().root.query_pointer()._data

print ("x="+str(d["root_x"]))
print ("y="+str(d["root_y"]))

Lembrando de instalar via apt-get:

sudo apt-get install python-xlib

Referência.